Touché lors de la finale du Mondial des Clubs et remplacé à la mi-temps par Pedrito, Seydou Keita manquera les premiers matches de Liga en 2010 contre Villarreal et à Tenerife. Le milieu international malien souffre d'une déchirure de deux centimètres à la cuisse droite. Cela demande trois semaines de repos. Il manquera également le huitième de finale aller de la Coupe du Roi face à Séville avant de s'envoler pour jouer la CAN avec son pays.